在某个时间点的日本，突然出现了文学书全部被染黑的怪异现象。 这是由书中带着负面情绪诞生的“侵蚀者”所导致的灾难。 被侵蚀的文学书，会逐渐地从人们记忆中消失，最后变得像是从一开始便不曾存在过一样。 于是，有特殊能力的“炼金术师”作为特务司书被派遣至图书馆， 为了对抗破坏书 中世界的“侵蚀者”、为了守护文学，与转世的文豪们一起战斗。
某天，时隔10年回到日本的少年一希东，突然遭到武装男子们的袭击，并被囚禁起来。而救出了东的人，是青梅竹马的少女朝吹黄金，以及有着右手形态、拥有意志的武器“舞武器”。知道了“舞武器”的存在，以及自身也是“舞武器使者”的东，与遇到的同伴们一起，为了让沉眠于地下、被称为“王舞”的舞乱伎（巨人）复活而开始行动。
这是一个关于你自身的故事。你体内的故事——。人的细胞数量，约为37兆2千亿个。细胞们在名为身体的世界中，今天也精神满满、无休无眠地在工作着。运送着氧气的红细胞，与细菌战斗的白细胞……！这里，有着细胞们不为人知的故事。
从《假面骑士Kuuga》起平成骑士系列的世界融合了！巡游于九个骑士世界，破坏与创造的故事即将拉开序幕！照相馆之女・夏海，梦见了众多假面骑士与谜之敌的交战。为何她能知道敌人的名字为Decade？那种纠葛下，她被楼下住在照相馆的流浪青年・士与客人的纠纷给惊醒。士通过摄影来赚钱，但好像从没拍到过像样的照片， 反而经常把客人们给惹怒。在夏海找到士的时侯，一阵怪风吹过世界各地开始了异变，怪物开始袭击人类。同时，假面骑士Kiva・渡出现在士的面前并传达给他：「巡游于9个不同的世界，并拯救它们。破坏所有的假面骑士・・・・・・」从突然出现的魔化魍手中逃脱的夏海，意外发现了腰带和卡片盒。夏海将腰带托付于士，而士则变身为假面骑士Decade。就这样，变身为Kabuto、Faiz、响鬼的战斗开始了……平成骑士十周年纪念作，初期穿越于九个平成骑士的世界，而到了后期更加穿越到侍战队真剑者，平成骑士RX、BLACK、亚马逊等的世界。
日本的上班族冈岛绿郎在一次去东南亚的出差中，被和海盗差不多的运输商“BLACK LAGOON”的成员绑架。公司为了保守机密派遣雇佣兵要抹煞掉成为了人质的冈岛，但是冈岛凭借其智慧从这绝境中脱险了。被公司抛弃的冈岛舍弃了了姓名和立场，改名Rock成为了“BLACK LAGOON”的成员。原军人的老板Dutch，机械工Benny，有“双枪”别名的枪手Revy，和Rock一起，乘坐改造鱼雷艇“BLACK LAGOON号”在南方的大海上驰骋着……而女主角则是美女双枪侠·蕾葳，任何危险的工作她都可以胜任！
1990年2月神户市北区俄勒冈村在孤儿院生活的双胞胎少年米奇与达利，有一天被富裕而安详的老夫妇园山夫妻收为了养子。但他们并非以「米奇」与「达利」两位少年的身份，而是以「园山秘鸟」这一位少年的身份被收养的。二人隐瞒了真实身份，在扮演园山秘鸟的同时融入俄勒冈村。二人究竟为何要扮演同一个人？其中包含着巨大的秘密和惊人的目的。
在遥远的神话时代，冥王哈迪斯曾率领108冥斗士向人类世界发起攻击，智慧女神雅典娜则率圣斗士们奋起迎敌。连番苦战之后，哈迪斯及其军团战败，他们全部被雅典娜封印，而圣斗士也几乎损伤殆尽。数千年后，女神的封印失去效力，古塔中的冥斗士又重新蠢蠢欲动。复活后的哈迪斯及其冥斗士将魔爪伸向圣域。连番恶战，圣域几近毁灭。参透阿赖耶识的处女座圣斗士沙加和女神雅典娜以活体闯入冥界。青铜5人组以女神之血修复业已破损的圣衣，随后闯入潘多拉城。战场移到黑暗的冥界，一场绵亘了数千年的正邪大战就此展开……
剧情接《倾物语》，在与忍野忍结束时间跳跃后回到当代的阿良良木历，向八九寺真宵归还遗落在阿良良木家的背包后，在路上却遭到不明物「暗（くらやみ）」的袭击。危机之际，被斧乃木余切搭救。在「叡考塾」废墟中，小忍向历讲述了自己400年前在日本与第一任眷属的相遇和遭到「暗」的袭击的经过。 再次遭到「暗」袭击的历与小忍失去了联系，最后在神秘的卧烟伊豆湖的帮助下得知了「暗」的正体是追杀偏离了怪异之道的怪异的非存在，而追杀的目标不是小忍而是八九寺真宵。 由于母亲节时得到阿良良木历的帮助，真宵回到了自己的家，而此刻的真宵已经成佛，但是真宵却迟迟不去那个世界报到，依然留在这个小镇。让人迷路的怪异「迷牛」却不再让人迷路，真宵已经偏离了怪异之道，因此，「暗」出现了，要将八九寺以及目击到八九寺的人类全部吞噬。最后，为保全大家，真宵含笑成佛。 《鬼物语》的时间顺序大致与猫物语（白）处于同一时间段，故事发生在《倾物语》之后，《囮物语》之前。 “不努力解除误会，等同於说谎。” 栖息于阿良良木历影子里的吸血鬼──忍野忍。 从她的记忆中唤醒，“超越怪异的威胁”是……!? 美丽吸血鬼的独白超越时空，吞噬现在── 这就是现代的怪异！怪异！怪异！ 这个谎言，你肯定也早已知晓。
故事讲述无聊的神明们制作了一个终极益智游戏《诸神的游戏》，从冰里长眠3000年，热爱游戏的前神明少女レオレーシェ苏醒后做出宣言，「带上这个时代最会玩的人！」，而被指名的フェイ是备受期待成为「近年最强的新人」的使徒，两人共同挑战难度极大且还没有人类能完全攻略的《诸神的游戏》。天才游戏少年、前神明少女与伙伴们就此展开和至高神明的终极脑力大战！
