卖炭维生的善良少年炭治郎，某天家人惨遭鬼杀害。而唯一幸存的妹妹祢豆子，却变化成鬼。遭到绝望现实打击的炭治郎，为了让妹妹恢复回人类，为了被杀害的家人向鬼报仇，决定踏上”猎鬼”之路。
某天，时隔10年回到日本的少年一希东，突然遭到武装男子们的袭击，并被囚禁起来。而救出了东的人，是青梅竹马的少女朝吹黄金，以及有着右手形态、拥有意志的武器“舞武器”。知道了“舞武器”的存在，以及自身也是“舞武器使者”的东，与遇到的同伴们一起，为了让沉眠于地下、被称为“王舞”的舞乱伎（巨人）复活而开始行动。
高中二年级的春天，雨宫莲转学至东京的“秀尽学园”。以某个事件为契机觉醒为“PERSONA”使者的莲，与新认识的伙伴们一同组成“心之怪盗团”。把沾满邪恶欲望的大人们的“扭曲欲望”给偷走，让其改过自新。另一方面，在城市中陆续发生了不可思议的精神暴走事件……以大都会“东京”为舞台，作为高中生过着日常生活的同时，放学后作为“心之怪盗团”活跃——。壮大的歹徒传奇就此拉开序幕！
E.U.联盟和布里塔利亚帝国旷日持久的战争在皇历2010年发生转机，帝国派出压倒性的兵力突袭远东日。在很短的时间内，日本这个国家不复存在，从此作为“11区”写入历史。旧日本人民流往世界各地，饱受歧视，心中满是愤懑和不甘。2017年，E.U.联军132部队向圣彼得堡挺进，但遭到帝国军队的围困，面临全军覆没的危险。联军少校蕾拉·玛露卡尔（坂本真绫 配音）将旧日本青年组成非正规军W Zero部队，并提出以这支部队营救132部队的建议。但是在最为凶险的前线，他们不过肩负着牺牲自己来营救友军的悲哀命运。惨烈的对决过后，W Zero部队的中尉日向瑛斗（入野自由 配音）成功完成任务。而战争还远远未曾结束，新的阴谋与危机浮出水面……
玉木真理（水濑祈 配音）是就读于多多良西高中二年级的女生，生性活泼开朗的她是一个容易对新鲜事物产生好奇心的女孩，但是本性中的谨慎和胆小又让她对这些事物往往浅尝辄止，无法深入。这一天，真理邂逅了名为小渕泽报濑（花泽香菜 配音）的同学，她的母亲是一名南极观测队队员，因此，从 很小的时候起，真理就对南极这片冰封的土地充满了好奇。在报濑的影响下，真理开始向往踏上南极的土地。性格开朗在便利店打工的三宅日向（井口裕香 配音）、虽然年龄小但意外的老成的白石结月（早见沙织 配音），在“南极Challenge”的队长藤堂吟（能登麻美子 配音）的带领下，少女们向着梦想开始了进发。
根岸崇一（岸尾大辅 配音）是一个老实巴交的青年，怀揣着对于未来的希冀，他只身一人来到东京念大学。崇一非常的热爱音乐，尤其是流行乐，他最大的梦想就是可以抱着吉他，将自己喜欢的歌唱给更多的人听。为了出人头地，崇一参加了新人音乐家招募的活动，哪知道在误打误撞之中加入了名叫“Detroit Metal City”的恶魔系重金属乐队，成为了其中的骨干。崇一在脸上涂抹古怪的油彩，违心的以嘶吼的方式唱着狂野劲爆的歌，哪知道他的表演竟然意外的大受好评，很快，崇一就在重金属摇滚圈里出了名。崇一暗恋着名为相川由利（长泽雅美 配音）女孩，糟糕的是，相川最讨厌的就是重金属了，为了成就自己小小的恋情，崇一处心积虑的想要隐瞒自己大大的秘密。
故事讲述无聊的神明们制作了一个终极益智游戏《诸神的游戏》，从冰里长眠3000年，热爱游戏的前神明少女レオレーシェ苏醒后做出宣言，「带上这个时代最会玩的人！」，而被指名的フェイ是备受期待成为「近年最强的新人」的使徒，两人共同挑战难度极大且还没有人类能完全攻略的《诸神的游戏》。天才游戏少年、前神明少女与伙伴们就此展开和至高神明的终极脑力大战！
